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李依明
副教授
liym2019@sustech.edu.cn

李依明,2009年于上海交通大学获生物医学工程系学士,2010年获海德堡大学医学物理硕士,2015年获卡尔斯鲁厄理工学院博士学位。之后获得EMBL-玛丽居里博士后奖学金,在欧洲分子生物学实验室总部和耶鲁大学任职博士后研究员和访问学者(2016-2019)。现为南方科技大学生物医学工程系副教授,博士生导师。长期致力于研究三维超高分辨显微成像技术及其生物应用,在光学仪器研发,光学理论和成像算法等方面积累了坚实的理论基础以及实验经验。迄今,以第一/通讯作者在Nature Methods、Nature Communications、Optics Letters等国际权威期刊发表多篇论文,于2020年获得国家海外高层次人才(青年项目),并入选“深圳市海外高层次人才B类”,并长期担任Nature Methods、 Light: Science & Applications、Optics Letters等期刊的审稿人。目前和包括来自EMBL,耶鲁大学,牛津大学和剑桥大学等多个实验室有合作关系。


实验室主页:https://li-lab-sustech.github.io/

 

教育背景
2010年-2015年 卡尔斯鲁厄理工学院应用物理系 博士
2009年-2010年 海德堡大学-医学物理硕士
2005年-2009年 上海交通大学-生物医学工程 本科

 

工作经历

2019年-至今 南方科技大学生物医学工程系, 副教授
2016年-2019年 欧洲分子生物实验室海德堡总部,博士后

2016.02-2016.09 耶鲁大学,访问学者

 

荣誉及奖励
2013年 International Symposium on Biomedical Imaging Travel Grant
2010-2013年 Karlsruhe school of optics and photonics fellowship
2016-2019 年 EIPOD-Marie Curie Postdoc Fellowship

 

代表论文

1.Yiming Li, Yu-Le Wu, Philipp Hoess, Markus Mund, and Jonas Ries. Depth-dependent PSF calibration and aberration correction for 3D single-molecule localization. Biomed. Opt. Express, 6, 2708-2718, (2019)
2. Yiming Li, Markus Mund, Philipp Hoess, Joran Deschamps, Ulf Matti, Bianca Nijmeijer,Vilma Jimenez Sabinina, Jan Ellenberg, Ingmar Schoen, Jonas Ries. Real-time 3D single-molecule localization using experimental point spread functions. Nat. Methods, 15, 367-369, (2018)

3.Yiming Li, Li Shang, G. Ulrich Nienhaus. Super-resolution imaging-based single particle tracking reveals dynamics of nanoparticle internalization by live cells. Nanoscale, 8, 7423-7429, (2016)

4.Yuji Ishitsuka, Natasha Savage, Yiming Li, Anna Bergs, Nathalie Grün, Daria Kohler, Rebecca Donnelly, G. Ulrich Nienhaus, Reinhard Fischer, Norio Takeshita. Superresolution microscopy reveals a dynamic picture of cell polarity maintenance during directional growth. Science Advances, 1, e1500947 (2016)

5.Yiming Li, Yuji Ishitsuka, Per Niklas Hedde, and G. Ulrich Nienhaus. Fast and efficient molecule detection in localization-based super-resolution microscopy by parallel adaptive histogram equalization. ACS Nano 7, 5207–5214 (2013)

6.Shuo Chen, Xiaorui Feng, Yiming Li, Chuanqing Zhou, Peng Xi, Qiushi Ren. Software Controlling algorithms for the system performance optimization of confocal laser scanning microscope. Biomed. Signal Process Control 3, 223-228 (2010)

7.Thevathasan, J. V. et al.Nuclear pores as versatile reference standards for quantitative superresolution microscopy. Nat. Methods 16, 1045–1053 (2019).

8.Yongdeng Zhang, et al., Nanoscale subcellular architecture revealed by multicolor 3D salvaged fluorescence imaging. Nature Methods, Accepted.

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