基本概况

       黄捷，副教授、研究员、博士生导师、公共卫生及应急管理学院应急管理研究中心执行主任、华大基因学院荣誉教授、北京大学全球健康发展研究院兼职研究员。先后就读于北京大学公共卫生学院（本科）、北京体育大学研究生院（硕士）、密西根大学信息学院（硕士）、北卡罗莱纳大学公共卫生学院（硕士）、剑桥大学（博士）。 曾任哈佛大学医学院讲师、美国退伍军人事务部波士顿荣军医院资深科学家。在国际著名学术期刊发表文章70余篇，其中包括在《自然》、《自然通讯》、《血液》、《核酸研究》、《生物信息》等国际一流杂志上发表的第一作者文章。个人著作《基因的名义》一书于2018年由《高等教育出版社》出版，同年入选“中华优秀科普图书榜”。个人著作《核酸大爆炸》一书于2022年由《北京大学出版社》出版。

研究方向

1. 全球卫生大数据研究：针对全球大流行性传染病（包括新冠病毒肺炎）的疫情大数据研究，基于传染病传播动力学模型的预测和决策研究，基于病原微生物全基因组的系统发生树（phylogeny）方法学研究，基于机器学习的病毒三维结构预测研究。

2. 慢性病决定因素研究：基于大队列（包括英国 UK Biobank）的系统生物学研究；聚焦心血管疾病、肥胖、老年痴呆症等全球公共卫生重点关注的慢性疾病的全基因组关联研究（GWAS）研究、基因风险评估研究（Polygenic Risk Score）。

3. 个人基因组学研究：个人全基因组测序数据深度挖掘，包括对自闭症和地中海贫血等疾病的生物信息学分析流程和方法创新。

教育经历

1. 2012年 1月 - 2015年7月, 英国剑桥大学生物科学博士

2. 2005年8月 - 2006年8月, 美国北卡大学卫生管理学硕士

3. 1999年9月 - 2002年4月，美国密西根大学信息科学硕士

4. 1996年9月 – 1999年6月，北京体育大学教育学硕士

5. 1991年9月 – 1996年6月，北京医科大学预防医学学士

工作经历

1. 2022年3月–至今  南方科技大学公共卫生与应急管理学院，副教授、研究员、博士生导师、应急管理研究中心执行主任

2. 2018年6月–2022年2月，北京大学公共卫生学院全球卫生学系研究员、博士生导师

3. 2015年6月–2018年4月，美国退伍军人医院波士顿荣军医院资深科学家

4. 2012年1月–2014年8月，英国桑格研究院（Wellcome Trust Sanger Institute）资深生物信息分析师

5. 2009年10月–2012年1月，美国国立卫生研究院Framingham Heart Study博士后

6. 2007年9月–2009年9月，哈佛大学麻省总医院人类基因研究中心博士后

7. 2006年8月 - 2007年8月，美国西北大学医学院神经疾病研究所资深生物信息分析师，

8. 2003年8月– 2005年7月，杜克大学医学院放射影像中心计算机程序员III

科研项目

1. 中国疾病预防控制中心（CDC），“新冠疫情防控策略调整模型研究方案”。

2. 科技部重大专项，“多学科视角新冠病毒溯源研究”。

3. 国家自然科学基金委员会面上项目，“基于大数据建模的新冠病毒肺炎疫苗接种策略与政策研究”。

4. 科技部主动健康和老龄化科技应对重大专项，“营养、运动对老年健康的影响和干预作用”。

5. 深圳市科创委重大专项，“新冠病毒新变异株疫情深圳防控策略研究”。

6. 深圳市医疗卫生三名工程高层次医学团队项目，“急救医疗体系及医疗优先分级调度系统建设项目”。

7. 深圳市医疗卫生三名工程高层次医学团队项目，“深圳市自闭症中心”。

8. 中国外文局当代中国与世界研究院，“人类卫生健康共同体的国际传播研究”。

9. 北京大学双一流建设，“全球卫生研究院全球卫生大数据中心平台建设”。

代表性论文（#共同一作，*通讯作者）

1. Huang J*, McLean GR, Dubee FC, Zheng ZJ, Two Pandemics in China, One Health in Chinese. BMJ Global Health. 2022. April.

2. Wang M, Wang S, Peng H, Huang J*, Wu T*, Qi L. Arterial stiffness, genetic risk, and type 2 diabetes: a prospective cohort study. Diabetes Care. 2022 April.

3. Huang J#, Liu J#, Ruiyi Tian, Na Zhang, Hannah Sherman, Patrick Zhuang, Christoph Budjan, Kevin Liu, Michelle Fong, Cullen Clairmont, Minseo Jang, Xue-Jun Kong. A Next Generation Sequencing-Based Protocol for Screening of Variants of Concern in Autism Spectrum Disorder. Cells. 2022

4. Huang J*, Zhi-Sheng Liang, Stefano Pallotti, Daniel A. King, Zhi-Jie Zheng, Qiang Zhou, Houfeng Zheng, Francesco M. Carpi, Valerio Napolioni*. PAGEANT: Personal access to genome & analysis of natural traits. Nucleic Acids Research. 2021 Dec 20;gkab1245

5. Huang J*, Pallotti S, Zhou Q, Kleber M, Xin X, King DA, Napolioni V*. PERHAPS: Paired-End short Reads-based HAPlotyping from next-generation Sequencing data. Briefings in Bioinformatics. 2020 Dec 8;bbaa320

6. Walter K#, Min JL#, Huang J#, Crooks L#. The UK10K project identifies rare variants in health and disease. Nature. 2015 Oct 1;526(7571):82-90.

7. Huang J#, Howie B, McCarthy S, Memari Y, Walter K, Min JL, Danecek P, Malerba G, Trabetti E, Zheng HF; UK10K Consortium., Gambaro G, Richards JB, Durbin R, Timpson NJ, Marchini J, Soranzo N. Improved imputation of low-frequency and rare variants using the UK10K haplotype reference panel. Nature Communications. 2015 Sep 14;6:8111

8. Huang J#,. Genome-wide association study for circulating levels of PAI-1 provides novel insights into its regulation. Blood. 2012 Dec 6;120(24):4873-81.

9. Huang J#, Johnson AD, O'Donnell CJ. PRIMe: a method for characterization and evaluation of pleiotropic regions from multiple genome-wide association studies. Bioinformatics. 2011 May 1;27(9):1201-6.

10. Huang J#, Perlis RH, Lee PH, Rush AJ, Fava M, Sachs GS, Lieberman J, Hamilton SP, Sullivan P, Sklar P, Purcell S, Smoller JW. Cross-disorder genomewide analysis of schizophrenia, bipolar disorder, and depression. American Journal of Psychiatry. 2010 Oct;167(10):1254-63.